外重复序列
( repetitive extragenic palindromic, REP)
和基因间重复序列
( enterobacterial repetitive inter鄄
genic consensus sequence, ERIC) . 2004
年
,Wojciech
等
[36]
对从人
、
猪和狐狸样品分离出的
35
株
Y. en鄄
terocolitica
,
分别用
ITS鄄profiling( intergenic transcribed
sequence, ITS)、REP鄄PCR
和
ERIC鄄PCR
三种方法分
型并比较
,
发现
REP鄄PCR
比另外两种方法的分辨力
高
,
从猪中分离的菌株与从人分离的菌株有相同的
基因型
,
说明人类感染的
Y. enterocolitica
有可能来
自于猪
.
同年
,Sachdeva
等
[37]
对分离的
81
株
1A
生
物型
Y. enterocolitica
菌株
,
用
REP鄄PCR
和
ERIC鄄
PCR
进行分型
,
分别可分为
19
和
23
个基因群
,
其中
大多菌株形成两个基因群
,
说明
Y. enterocolitica
1A
生物型主要由两个克隆群组成
,
其中
ERIC鄄PCR
分
辨力更高
. 2006
年
,Falcao
等
[38]
对从人
、
动物和食
品中分离的
Y. enterocolitica
菌株用
PFGE
和
ERIC鄄
PCR
进行分型
,
分离株主要为
4 / O:3
生物血清型
,
从人和动物分离的
4 / O:3
型菌株基因相似度比从
食品分离的高
,PFGE
分辨力比
ERIC鄄PCR
更好
.
近
年来本实验室先后建立了阪崎肠杆菌
[39]
、
铜绿假单
胞菌
[40]
、
蜡样芽孢杆菌
[7]
、
空肠弯曲菌
[41]
等的
ERIC鄄PCR
分型方法
,2013
年
,
在此基础上建立了
Y. enterocolitica
的
ERIC鄄PCR
分型方法
,
把从食品中
分离的小肠结肠炎耶尔森氏菌进行
ERIC鄄PCR
分子
分型研究
,72
个分离株可分为
56
个型共四大簇
,
其
中优势菌株主要集中在第三簇
.
该方法操作简单
、
成本较低
、
分型效果好
,
克服了传统分型方法的不
足
,
因此适用于大量的食源性
Y. enterocolitica
的分
型研究
,
为研究食源性
Y. enterocolitica
的遗传多样
性及其分布规律打下良好的基础
.
2郾 3摇
多位点序列分型
多 位 点 序 列
( multilocus sequence typing,
MLST)
分型法利用
MLST
对研究菌种的少数几个管
家基因进行等位基因序列分析
,
重复性好
、
可标准
化
,
核酸序列的数字化存储方式便于通过网络在不
同实验室之间进行传输比对
,
目前
MLST
被广泛应
用于多种病原菌的分型和进化
. 2005
年
,Kotetishvili
等
[42]
对耶尔森菌属多个种的细菌使用
16Sr RNA
基
因和其他四个管家基因进行
MLST
分析
,
发现鼠疫
耶尔森菌与假结核耶尔森菌具有较近的亲缘关系
,
是同一谱系的两个物种
,
而鲁氏耶尔森菌是和本属
细菌亲缘关系最远的一种
. 2009
年
,
王鑫等
[43]
用七
个管家基因对
Y. enterocolitica
进行
MLST
分析
,
结
果发现菌株明显的形成了致病性菌株与非致病性菌
株两大类别
,
致病性菌株型别集中
,
相同血清型致病
菌呈现出高度的相似性
;
而非致病性菌株型别分散
,
没有明显的流行病学关联
,
呈现明显的多态性
.
2012
年
,Sihvonen
等
[44]
对从人临床样本分离的
Y.
enterocolitica
1A
生物型菌株用
16S rRNA
基因和七
个管家基因进行
MLST
分析
,MLST
将菌株分成两个
不同谱系
,
基因组
1
和基因组
2,
其中基因组
1
和致
病性菌株生物血清
4 / O:3
型相似性更高
,
这可能表
明这些
1A
生物型菌株存在潜在致病性
. 2014
年
,
Duan
等
[45]
用
52
株鼠疫耶尔森氏菌
(
Yersinia pes鄄
tis
)、762
株假结核耶尔森氏菌
(
Yersinia pseudotuber鄄
culosis
)
和
201
株
Y. enterocolitica
这三种致病性耶尔
森氏菌为研究对象
,
用
MLST
研究它们的物种进化
关系
,MLST
分析显示这三种耶尔森氏菌分为两个
组
,
第一组为
Y. pestis
和
Y. pseudotuberculosis
,
Y.
pestis
的主要序列型
ST90
与
Y. pseudotuberculosis
的
ST43
有关联
,
它们只有一个位点的差异
,81郾 25%
的
ST43
菌株血清型为
O:1b
型
,
支持了
Y. pestis
为血
清型
O:1b
的
Y. pseudotuberculosis
的后裔的观点
,
第
二组为致病性和非致病性的
Y. enterocolitica
,
其中
致病性
Y. enterocolitica
菌株形成了相对保守的一
群
,
另外血清型
O: 3、O: 8
和
O:9
被分成三个不同
的部分
,
而非致病性的菌株则很分散
.
3摇
展
摇
望
通过
Y. enterocolitica
的生物型
、
血清型和毒力
基因可以反映出其致病能力
,
已有研究表明我国致
病性菌株以
3 / O:3
和
2 / O:9
型为主
;
Y. enterocoliti鄄
ca
1A
生物型可能具有潜在致病性
,
携带的
ail
基因
序列不同会具有不同的致病力
;
近年来
,
Y. enteroco鄄
litica
中耐多种抗生素的
“
超级
冶
菌株日益普遍
,
掌握
它们对抗生素的药敏型别有助于控制其危害
;
因此
摸索该菌生物型
、
血清型和毒力基因之间的联系
,
找
出流行的致病菌株
,
了解该菌耐药能力的变化
,
对有
针对性的控制致病菌的危害有重大意义
,
下一步我
们将对从食品污染调查中分离出的
Y. enterocolitica
进行毒力基因检测
、
生物
/
血清分型
,
以了解其致病
性
;
并对分离株进行药敏实验
,
确定其耐药性和敏感
4
食品科学技术学报
摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇
摇 2014
年
7
月