Page 26 - 食品科学技术学报2018年第5期
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第 36 卷 第 5 期摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 王摇 鹏等: 绵甜型白酒酒醅原核微生物群落结构分析                                     2 1


   1郾 3郾 3摇 酒醅 DNA 浓度及纯度检验                           以看出,细菌群落检测覆盖率均在 99郾 4% 以上,基本可
       采用核酸蛋白检测仪检测酒醅样品 DNA 浓度                        以反映出酒醅样品中全部的原核微生物多样性及结
   及纯度。                                              构。 从样品种类来看,1 号窖池酒醅中的原核微生物多
                                                     样性要高于 2 号窖池酒醅中的原核微生物。
   2摇 结果与分析
                                                          表 2摇 酒醅样品中原核微生物群落多样性指数
   2郾 1摇 酒醅 DNA 浓度及纯度检测结果                                Tab. 2摇 Diversity index of prokaryotic microorganism
       通过对酒醅样品进行核酸蛋白检测,得到酒醅                                     community in fermented grains
   样品的 DNA 浓度和纯度,结果见表 1。 由表 1 可以                        样品   种类 Shannon Simpson  Chao1  ACE  群落检测
                                                        编号                                 覆盖率/ %
   看出,从酒醅中提取的 DNA 质量浓度均在 13 滋g/ mL
                                                       D1LU   827  6郾 54  0郾 97  896郾 07  924郾 59  99郾 6
   以上,其 OD        值在 1郾 5 ~ 2郾 1。 检测所得曲线线
              260 / 280                                D1LM   816  6郾 52  0郾 97  916郾 75  918郾 33  99郾 5
   性较好,适宜于 PCR 扩增及后期的高通量测序。                            D1LD   790  6郾 55  0郾 97  868郾 90  886郾 72  99郾 6
                                                       D1HU   585  6郾 19  0郾 97  596郾 01  611郾 67  99郾 8
               表 1摇 酒醅样品浓度及纯度
                                                       D1HM   572  5郾 88  0郾 96  618郾 15  638郾 49  99郾 7
        Tab. 1摇 Concentrations and purities of samples of  D1HD  663  6郾 23  0郾 97  716郾 55  730郾 45  99郾 7
              fermented grains                          D7L   768  6郾 05  0郾 94  935郾 41  927郾 17  99郾 4
                                                        D7H   545  5郾 71  0郾 95  657郾 84  664郾 78  99郾 6
                                 籽/
     样品编号        样品名称                    OD 260 / 280  D13L   477  4郾 99  0郾 92  648郾 59  675郾 25  99郾 5
                                    - 1
                              (滋g·mL  )
                                                       D13H   358  4郾 28  0郾 85  455郾 07  445郾 72  99郾 7
      D1LU   1 号池第 1 天酒醅上层      16郾 58    1郾 93
                                                       D21L   190  3郾 33  0郾 78  236郾 41  252郾 21  99郾 8
      D1LM   1 号池第 1 天酒醅中层      13郾 31    2郾 11
                                                       D21H   127  2郾 51  0郾 68  191郾 57  209郾 79  99郾 8
      D1LD   1 号池第 1 天酒醅下层      13郾 90    2郾 01
                                                       D31L   151  3郾 41  0郾 82  198郾 22  221郾 58  99郾 8
      D1HU   2 号池第 1 天酒醅上层      13郾 62    2郾 06
                                                       D31H   158  2郾 86  0郾 72  200郾 43  215郾 58  99郾 8
      D1HM   2 号池第 1 天酒醅中层      22郾 62    1郾 95
                                                       D46LU  160  3郾 42  0郾 82  229郾 39  247郾 49  99郾 8
      D1HD   2 号池第 1 天酒醅下层      13郾 70    1郾 78
                                                       D46LM  212  3郾 76  0郾 85  247郾 25  250郾 00  99郾 9
      D7L    1 号池第 1 天酒醅混合      19郾 82    1郾 55
                                                       D46LD  269  3郾 79  0郾 85  338郾 38  341郾 61  99郾 8
      D7H    2 号池第 1 天酒醅混合      16郾 65    1郾 92
                                                       D46HU  129  2郾 92  0郾 74  164郾 36  180郾 99  99郾 9
      D13L   1 号池第 1 天酒醅混合      14郾 05    1郾 75
                                                       D46HM  117  2郾 65  0郾 70  156郾 42  172郾 99  99郾 9
      D13H   2 号池第 1 天酒醅混合      17郾 44    2郾 07
                                                       D46HD  107  2郾 48  0郾 68  144郾 14  164郾 77  99郾 9
      D21L   1 号池第 1 天酒醅混合      19郾 84    2郾 02
      D21H   2 号池第 1 天酒醅混合      19郾 24    1郾 57      2郾 3摇 OTU 分析
      D31L   1 号池第 1 天酒醅混合      22郾 49    1郾 80
      D31H   2 号池第 1 天酒醅混合      22郾 86    1郾 78          为了研究酒醅中物种的组成多样性信息,用 Up鄄
     D46LU   1 号池第 1 天酒醅上层      28郾 24    1郾 74      arse 软件对所有酒醅样品的全部 Effective Tags 序列聚
     D46LM   1 号池第 1 天酒醅中层      19郾 17    1郾 72
                                                     类,提供以 97% 的一致性将序列聚类成为 OTUs 结
     D46LD   1 号池第 1 天酒醅下层      22郾 05    1郾 99
     D46HU   2 号池第 1 天酒醅上层      27郾 80    1郾 76      果 [16] 。 按所有酒醅样品间序列最小值对 OTUs 聚类结
     D46HM   2 号池第 1 天酒醅中层      28郾 06    1郾 86      果进行标准化处理后,根据 OTUs 聚类分析结果和研究
     D46HD   2 号池第 1 天酒醅下层      21郾 66    1郾 86
                                                     需求,分析不同酒醅样品之间的 OTUs 的共有、特有信
   2郾 2摇 酒醅中原核微生物群落多样性指数分析                           息,并绘制韦恩图,展示结果见图 1。
       用 Alpha Diversity 分析酒醅样品内的群落多样                摇 摇 由图 1(a)可以看出,1 号、2 号窖池酒醅中分别
   性。 对不同样品在不同一致性阈值水平(默认提供                           含有细菌种类 1 304、1 036 个。 1 号和 2 号窖池酒醅
   97% 、95% 两个阈值)下的 Alpha Diversity 分析的指             中含有相同种类细菌 914 个,可以看出,1 号窖池和
   数进行统计      [14]  。 其中,97% 水平下聚类成为一个               2 号窖池酒醅中的原核微生物种类相似度较高。

   OTU 的序列被认为可能是源自于同一个种的序列;                              由图 1(b)可以看出,1 号窖池第 1 天上、中、下
   95% 水平下聚类成为一个 OTU 的序列被认为可能                        层酒醅中分别含有细菌种类 827、816、790 个,上、
   是源自于同一个属的序列              [15]  。 Shannon、Simpson、  中、下三层酒醅中含有相同种类的细菌 489 个。 由
   Chao1 和 ACE 是反应样品丰富度和多样性的重要                       图 1(c)可以看出,2 号窖池第 1 天上、中、下层酒醅
   指标,微生物群落多样性与 Shannon 成正比,Shannon                  中分别含有细菌种类 585、572、663 个,上、中、下三
   越大,微生物群落多样越丰富,结果见表 2。 由表 2 可                      层酒醅中含有相同种类的细菌 363 个。 由图 1(d)
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