Page 26 - 食品科学技术学报2018年第5期
P. 26
第 36 卷 第 5 期摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 王摇 鹏等: 绵甜型白酒酒醅原核微生物群落结构分析 2 1
1郾 3郾 3摇 酒醅 DNA 浓度及纯度检验 以看出,细菌群落检测覆盖率均在 99郾 4% 以上,基本可
采用核酸蛋白检测仪检测酒醅样品 DNA 浓度 以反映出酒醅样品中全部的原核微生物多样性及结
及纯度。 构。 从样品种类来看,1 号窖池酒醅中的原核微生物多
样性要高于 2 号窖池酒醅中的原核微生物。
2摇 结果与分析
表 2摇 酒醅样品中原核微生物群落多样性指数
2郾 1摇 酒醅 DNA 浓度及纯度检测结果 Tab. 2摇 Diversity index of prokaryotic microorganism
通过对酒醅样品进行核酸蛋白检测,得到酒醅 community in fermented grains
样品的 DNA 浓度和纯度,结果见表 1。 由表 1 可以 样品 种类 Shannon Simpson Chao1 ACE 群落检测
编号 覆盖率/ %
看出,从酒醅中提取的 DNA 质量浓度均在 13 滋g/ mL
D1LU 827 6郾 54 0郾 97 896郾 07 924郾 59 99郾 6
以上,其 OD 值在 1郾 5 ~ 2郾 1。 检测所得曲线线
260 / 280 D1LM 816 6郾 52 0郾 97 916郾 75 918郾 33 99郾 5
性较好,适宜于 PCR 扩增及后期的高通量测序。 D1LD 790 6郾 55 0郾 97 868郾 90 886郾 72 99郾 6
D1HU 585 6郾 19 0郾 97 596郾 01 611郾 67 99郾 8
表 1摇 酒醅样品浓度及纯度
D1HM 572 5郾 88 0郾 96 618郾 15 638郾 49 99郾 7
Tab. 1摇 Concentrations and purities of samples of D1HD 663 6郾 23 0郾 97 716郾 55 730郾 45 99郾 7
fermented grains D7L 768 6郾 05 0郾 94 935郾 41 927郾 17 99郾 4
D7H 545 5郾 71 0郾 95 657郾 84 664郾 78 99郾 6
籽/
样品编号 样品名称 OD 260 / 280 D13L 477 4郾 99 0郾 92 648郾 59 675郾 25 99郾 5
- 1
(滋g·mL )
D13H 358 4郾 28 0郾 85 455郾 07 445郾 72 99郾 7
D1LU 1 号池第 1 天酒醅上层 16郾 58 1郾 93
D21L 190 3郾 33 0郾 78 236郾 41 252郾 21 99郾 8
D1LM 1 号池第 1 天酒醅中层 13郾 31 2郾 11
D21H 127 2郾 51 0郾 68 191郾 57 209郾 79 99郾 8
D1LD 1 号池第 1 天酒醅下层 13郾 90 2郾 01
D31L 151 3郾 41 0郾 82 198郾 22 221郾 58 99郾 8
D1HU 2 号池第 1 天酒醅上层 13郾 62 2郾 06
D31H 158 2郾 86 0郾 72 200郾 43 215郾 58 99郾 8
D1HM 2 号池第 1 天酒醅中层 22郾 62 1郾 95
D46LU 160 3郾 42 0郾 82 229郾 39 247郾 49 99郾 8
D1HD 2 号池第 1 天酒醅下层 13郾 70 1郾 78
D46LM 212 3郾 76 0郾 85 247郾 25 250郾 00 99郾 9
D7L 1 号池第 1 天酒醅混合 19郾 82 1郾 55
D46LD 269 3郾 79 0郾 85 338郾 38 341郾 61 99郾 8
D7H 2 号池第 1 天酒醅混合 16郾 65 1郾 92
D46HU 129 2郾 92 0郾 74 164郾 36 180郾 99 99郾 9
D13L 1 号池第 1 天酒醅混合 14郾 05 1郾 75
D46HM 117 2郾 65 0郾 70 156郾 42 172郾 99 99郾 9
D13H 2 号池第 1 天酒醅混合 17郾 44 2郾 07
D46HD 107 2郾 48 0郾 68 144郾 14 164郾 77 99郾 9
D21L 1 号池第 1 天酒醅混合 19郾 84 2郾 02
D21H 2 号池第 1 天酒醅混合 19郾 24 1郾 57 2郾 3摇 OTU 分析
D31L 1 号池第 1 天酒醅混合 22郾 49 1郾 80
D31H 2 号池第 1 天酒醅混合 22郾 86 1郾 78 为了研究酒醅中物种的组成多样性信息,用 Up鄄
D46LU 1 号池第 1 天酒醅上层 28郾 24 1郾 74 arse 软件对所有酒醅样品的全部 Effective Tags 序列聚
D46LM 1 号池第 1 天酒醅中层 19郾 17 1郾 72
类,提供以 97% 的一致性将序列聚类成为 OTUs 结
D46LD 1 号池第 1 天酒醅下层 22郾 05 1郾 99
D46HU 2 号池第 1 天酒醅上层 27郾 80 1郾 76 果 [16] 。 按所有酒醅样品间序列最小值对 OTUs 聚类结
D46HM 2 号池第 1 天酒醅中层 28郾 06 1郾 86 果进行标准化处理后,根据 OTUs 聚类分析结果和研究
D46HD 2 号池第 1 天酒醅下层 21郾 66 1郾 86
需求,分析不同酒醅样品之间的 OTUs 的共有、特有信
2郾 2摇 酒醅中原核微生物群落多样性指数分析 息,并绘制韦恩图,展示结果见图 1。
用 Alpha Diversity 分析酒醅样品内的群落多样 摇 摇 由图 1(a)可以看出,1 号、2 号窖池酒醅中分别
性。 对不同样品在不同一致性阈值水平(默认提供 含有细菌种类 1 304、1 036 个。 1 号和 2 号窖池酒醅
97% 、95% 两个阈值)下的 Alpha Diversity 分析的指 中含有相同种类细菌 914 个,可以看出,1 号窖池和
数进行统计 [14] 。 其中,97% 水平下聚类成为一个 2 号窖池酒醅中的原核微生物种类相似度较高。
OTU 的序列被认为可能是源自于同一个种的序列; 由图 1(b)可以看出,1 号窖池第 1 天上、中、下
95% 水平下聚类成为一个 OTU 的序列被认为可能 层酒醅中分别含有细菌种类 827、816、790 个,上、
是源自于同一个属的序列 [15] 。 Shannon、Simpson、 中、下三层酒醅中含有相同种类的细菌 489 个。 由
Chao1 和 ACE 是反应样品丰富度和多样性的重要 图 1(c)可以看出,2 号窖池第 1 天上、中、下层酒醅
指标,微生物群落多样性与 Shannon 成正比,Shannon 中分别含有细菌种类 585、572、663 个,上、中、下三
越大,微生物群落多样越丰富,结果见表 2。 由表 2 可 层酒醅中含有相同种类的细菌 363 个。 由图 1(d)

